خویش، برنامه‌ها و فعالیت‌های گوناگون و گسترده‌ای را تدارک دیده است که برخی از مهم‌ترین آنها عبارت‎اند از:^۱

۱. سازماندهی و برگزاری همایش‌ها، جلسات سخنرانی و کنفرانس‌هایی در سطوح داخلی و بین‎المللی با موضوعاتی مانند بنیادگرایی اسلامی، منازعات اسرائیل و فلسطین، جنبش‌های اسلامی، روابط اسرائیل و ترکیه، مسائل سیاسی جمهوری اسلامی ایران از جمله روند انتخابات در ایران، روابط اسرائیل و اردن، روابط اسرائیل با کشورهای عربی (با تأکید بر کشورهای آفریقای شمالی) و وضعیت اقلیت عربی در اسرائیل؛

۲. تحلیل و بررسی مهم‌ترین مسائل مرتبط با منطقه خاور میانه.

هفتم: همکاری‌ها و ارتباطات مرکز

مرکز مطالعات موشه دایان برای اجرای برنامه‌های خود، همکاری و ارتباط گسترده‌ای با مؤسسه‌ها و مرکزهای تحقیقاتی خارج از اسرائیل، از جمله مؤسسه سیاست خارجی ترکیه در آنکارا، مؤسسه امور بین‎المللی رویال در لندن و مؤسسه واشنگتن برای مطالعه خاور نزدیک در امریکا و بسیاری از مؤسسات دیگر در اروپا و امریکا برقرار کرده است. همچنین در راستای تبادل اطلاعات، با بسیاری از دانشگاه‌های معتبر جهان -  از جمله هاروارد، مک گیل، کلمبیا و...  - ارتباط نزدیکی دارد.^۲

هشتم: انتشارات مرکز

فعالیت‌های علمی، اطلاع‌رسانی و تحقیقاتی این مرکز به صورت کتاب، مقالات و نشریه تخصصی، ارائه می‌شود. مهم‌ترین کتاب‌های منتشر شده در این مرکز،

چهارم: شورای مشورتی مرکز

شورای مشورتی در این مرکز، وظیفه ارائه خدمات مشورتی در زمینه مسائل سیاسی خاور میانه به تصمیم‌گیرندگان سیاسی و همچنین نهادهای دولتی اسرائیل را بر عهده دارد. این شورا، سی عضو دارد که همگی محققان و اندیشمندان برجسته اسرائیلی و غیراسرائیلی هستند.^۱ اشخاصی مانند یوسف بن شلوموها،^۲ موشه آرنز،^۳ شموئل کاتز^۴ و ویلیام ون کلیو^۵ از کانادا، از جمله اعضای این شورای مشورتی هستند.^۶

پنجم: اهداف مرکز

مرکز مطالعات خاور میانه‌ای و آفریقایی موشه دایان، به گفته مسئولانش اهداف ذیل را دنبال می‌کند:^۷

۱. ارتقای دانش سیاسی مردم منطقه خاور میانه در جهت پیشبرد روند صلح؛

۲. ایجاد شبکه ارتباطی میان مؤسسات و مراکز تحقیقاتی در سطوح داخلی، منطقه‌ای و بین‎المللی در جهت همکاری و تبادل نظر، عقاید و پژوهش‌های آنها درباره مسائل مرتبط با منطقه خاور میانه؛

۳. فراهم آوردن بستری مناسب برای نشست‌های تخصصی در عرصه مسائل سیاسی منطقه.

ششم: برنامه‌های مرکز

مرکز مطالعات خاور میانه‌ای و آفریقایی موشه دایان در راستای رسیدن به اهداف