النجف الأشرف، كتبها في النجف الأشرف سنة (۷۷۸ه)، و هي تحتوي على رسائل:
أ. أسئلة السيّد ركن الدين الإسترابادي (المتوفّى حدود سنة ۷۱۷ه)، وهي عشرون مسألة حكميّة ومنطقية سألها من اُستاذه خواجه نصير الدين الطوسي (ت۶۷۲ه).
ب . رسالة في العشق؛ للشيخ الرئيس أبي عليّ الحسين بن عبد اللَّه بن سينا.
ج . فوائد في الحكمة و الكلام؛ للخواجه نصير الدين الطوسي. و هي خمسة فوائد بهذه العناوين: فائدة في بقاء النفس الإنسانيّة بعد خراب البدن، فائدة في الخير والشرّ، فائدة في صدور الكثرة عن الواحد، فائدة في ضرورة الموت، فائدة في عدم انفكاك العلّة التامّة عن معلولها. ۱
۴. نظم رسالة حيّ بن يقظان و رسالة الطير. كلاهما بخطّ ابن العتائقي.
۵. رسالة في أحوال النفس الإنسانيّة؛ لابن سينا. ۲
۶. رسالة في الدلالة؛ لفخر الدين أبي الحسن عليّ بن محمّد البندهي المعروف بابن البديع. ۳
۷. شرح العمدة ؛ لابن مالك النحوي. كتبها في سنة (۷۳۴ه) في المدرسة المستنصريّة ببغداد. ۴
۸. تحرير إقليدس (أو تحرير اُصول الهندسة) ؛ للطاووسي. نسخة منه بخطّ ابن العتائقي موجودة في الخزانة الرضويّة، رآها السيّد الأمين. ۵
۹. منهاج اليقين في اُصول الدين؛ للعلّامة الحلّي. مخطوطة منه في مكتبة البرلمان الإيراني السابق رقم ۶۲۹۰ وعليها خطّ ابن العتائقي. ۶
آثاره العلميّة
۱. اختيار حقائق الخلل في دقائق الحيل. ذكره الأفندي في رياض العلماء و قال : «... و قد ذكره الكفعمي في كتاب مجموعة الغرائب، ثمّ نسب إليه كتاب اختيار حقائق الخلل